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A robust transformer-based pipeline of 3D cell alignment, denoise and instance segmentation on electron microscopy sequence images 期刊论文
Journal of Plant Physiology, 2024, 页码: 154236
作者:  Jiazheng, Liu;  Yafeng, Zheng;  Limei, Lin;  Jingyue, Guo;  Yanan, Lv;  Jingbin, Yuan;  Hao, Zhai;  Xi, Chen;  Lijun, Shen;  LinLin, Li;  Shunong, Bai;  Hua, Han
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Denoising of scanning electron microscope images for biological ultrastructure enhancement 期刊论文
JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2022, 卷号: 20, 期号: 03, 页码: 21
作者:  Chang, Sheng;  Shen, Lijun;  Li, Linlin;  Chen, Xi;  Han, Hua
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SEM  noise model  denoising  variance stabilization transformation  two-stage multi-loss  deep learning  
An effective AI integrated system for neuron tracing on anisotropic electron microscopy volume 期刊论文
Biomedical Signal Processing and Control, 2021, 卷号: 69, 期号: 无, 页码: 102829
作者:  Liu, Jing;  Hong, Bei;  Chen, Xi;  Xie, Qiwei;  Tang, Yuanyan;  Han, Hua
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Neuron tracing  Electron microscopy  Deep learning  Convolutional LSTM  
An automated pipeline for mitochondrial segmentation on ATUM-SEM stacks 期刊论文
JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2017, 卷号: 15, 期号: 3, 页码: 1750015
作者:  Li, Weifu;  Deng, Hao;  Rao, Qiang;  Xie, Qiwei;  Chen, Xi;  Han, Hua
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Atum-sem  Membrane Enhancement  Mitochondria  Group-similarity