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A novel registration method for long-serial section images of EM with a serial split technique based on unsupervised optical flow network 期刊论文
BIOINFORMATICS, 2023, 卷号: 39, 期号: 8, 页码: 11
作者:  Xin, Tong;  Lv, Yanan;  Chen, Haoran;  Li, Linlin;  Shen, Lijun;  Shan, Guangcun;  Chen, Xi;  Han, Hua
收藏  |  浏览/下载：112/0  |  提交时间：2023/11/17
An intelligent workflow for sub-nanoscale 3D reconstruction of intact synapses from serial section electron tomography 期刊论文
BMC BIOLOGY, 2023, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 14
作者:  Chang, Sheng;  Li, Linlin;  Hong, Bei;  Liu, Jing;  Xu, Yuxuan;  Pang, Keliang;  Zhang, Lina;  Han, Hua;  Chen, Xi
收藏  |  浏览/下载：87/0  |  提交时间：2023/11/16
Serial section electron tomography  3D EM  Semi-auto locating  Auto-alignment  Missing-information restoration  Semi-auto segmentation  Workflow  Synapse  
Deep residual contextual and subpixel convolution network for automated neuronal structure segmentation in micro-connectomics 期刊论文
Computer Methods and Programs in Biomedicine, 2022, 卷号: 219, 页码: 106759
作者:  Xiao, Chi;  Hong, Bei;  Liu, Jing;  Tang, Yuanyan;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
Adobe PDF(2731Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：236/59  |  提交时间：2023/01/12
Deep learning  Neuronal structure segmentation  Subpixel convolution  Electron microscopy  Micro-Connectomics  
STDIN: Spatio-temporal distilled interpolation for electron microscope images 期刊论文
NEUROCOMPUTING, 2022, 卷号: 505, 页码: 188-202
作者:  Wang, Zejin;  Sun, Guodong;  Li, Guoqing;  Shen, Lijun;  Zhang, Lina;  Han, Hua
Adobe PDF(6579Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：247/23  |  提交时间：2022/11/14
Spatio-temporal ensemble  Feedback distillation  Electron microscope interpolation  
Joint reconstruction of neuron and ultrastructure via connectivity consensus in electron microscope volumes 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 23
作者:  Hong,Bei;  Liu,Jing;  Zhai,Hao;  Liu,Jiazheng;  Shen,Lijun;  Chen,Xi;  Xie,Qiwei;  Han,Hua
Adobe PDF(3091Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：319/78  |  提交时间：2022/11/14
Connectomics  Reconstruction  Connectivity concept  Joint optimization  Electron microscope volumes  
Synaptic degeneration in the prefrontal cortex of a rat AD model revealed by volume electron microscopy 期刊论文
Journal of Molecular Cell Biology, 2022, 页码: 已录用
作者:  Yi Jiang;  Linlin Li;  Keliang Pang;  Jiazheng Liu;  Bohao Chen;  Jingbin Yuan;  Lijun Shen;  Xi Chen;  Bai Lu;  Hua Han
Adobe PDF(689Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：390/161  |  提交时间：2022/07/01
Robust Frequency-Aware Instance Segmentation for Serial Tissue Sections 会议论文
, 韩国济州岛, 2021-11-12
作者:  Sun GD(孙国栋);  Wang ZJ(王泽锦);  Li GQ(李国庆);  Han H(韩华)
Adobe PDF(1188Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：228/56  |  提交时间：2022/06/15
Serial sections  Instance segmentation  Computer vision  
Using Scale Information to Improve SIFT-Based Electron Microscope Image Registration Method 会议论文
, 中国浙江省杭州市, 2019-9
作者:  Chen BH(陈波昊);  Chang S(常胜);  Chen X(陈曦);  Han H(韩华)
Adobe PDF(554Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：154/55  |  提交时间：2022/06/14
SIFT  Image Registration  RANSAC  Electron Microscope  
Performance Analysis in Serial-section Electron Microscopy Image Registration of Neuronal Tissue 会议论文
, 美国圣地亚哥, 2022-1
作者:  Chen BH(陈波昊);  Xin T(辛桐);  Han H(韩华);  Chen X(陈曦)
Adobe PDF(1634Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：235/57  |  提交时间：2022/06/14
Registration accuracy  Serial section  Neuronal structure  Spherical deformation model  
An Effective Encoder-Decoder Network for Neural Cell Bodies and Cell Nucleus Segmentation of EM Images 会议论文
, 德国柏林, 2019-7
作者:  Jiang Yi;  Xiao Chi;  Li Linlin;  Shen Lijun;  Chen Xi;  Han Hua
Adobe PDF(6217Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：197/53  |  提交时间：2022/06/14
Encoder-Decoder  Electron Microscopy  Neural Cell Bodies  Cell Nucleus  Image Segmentation