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A robust transformer-based pipeline of 3D cell alignment, denoise and instance segmentation on electron microscopy sequence images 期刊论文
Journal of Plant Physiology, 2024, 页码: 154236
作者:  Jiazheng, Liu;  Yafeng, Zheng;  Limei, Lin;  Jingyue, Guo;  Yanan, Lv;  Jingbin, Yuan;  Hao, Zhai;  Xi, Chen;  Lijun, Shen;  LinLin, Li;  Shunong, Bai;  Hua, Han
Adobe PDF(15549Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：44/13  |  提交时间：2024/06/11
Thickness Estimation of Biological Tissue Sections from Structural Deformation 会议论文
, 中国西安, 2023-9-23
作者:  Jia HZ(贾浩泽);  Lv YN(吕亚楠);  Chen HR(陈浩然);  Chen X(陈曦);  Han H(韩华)
Adobe PDF(2427Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：57/20  |  提交时间：2024/05/31
STDIN: Spatio-temporal distilled interpolation for electron microscope images 期刊论文
NEUROCOMPUTING, 2022, 卷号: 505, 页码: 188-202
作者:  Wang, Zejin;  Sun, Guodong;  Li, Guoqing;  Shen, Lijun;  Zhang, Lina;  Han, Hua
Adobe PDF(6579Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：296/30  |  提交时间：2022/11/14
Spatio-temporal ensemble  Feedback distillation  Electron microscope interpolation  
Joint reconstruction of neuron and ultrastructure via connectivity consensus in electron microscope volumes 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 23
作者:  Hong,Bei;  Liu,Jing;  Zhai,Hao;  Liu,Jiazheng;  Shen,Lijun;  Chen,Xi;  Xie,Qiwei;  Han,Hua
Adobe PDF(3091Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：388/90  |  提交时间：2022/11/14
Connectomics  Reconstruction  Connectivity concept  Joint optimization  Electron microscope volumes  
Robust Frequency-Aware Instance Segmentation for Serial Tissue Sections 会议论文
, 韩国济州岛, 2021-11-12
作者:  Sun GD(孙国栋);  Wang ZJ(王泽锦);  Li GQ(李国庆);  Han H(韩华)
Adobe PDF(1188Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：264/67  |  提交时间：2022/06/15
Serial sections  Instance segmentation  Computer vision  
An Effective Encoder-Decoder Network for Neural Cell Bodies and Cell Nucleus Segmentation of EM Images 会议论文
, 德国柏林, 2019-7
作者:  Jiang Yi;  Xiao Chi;  Li Linlin;  Shen Lijun;  Chen Xi;  Han Hua
Adobe PDF(6217Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：240/63  |  提交时间：2022/06/14
Encoder-Decoder  Electron Microscopy  Neural Cell Bodies  Cell Nucleus  Image Segmentation  
Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions 期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY, 2021, 卷号: 13, 期号: 9, 页码: 636-645
作者:  Jiang, Yi;  Li, Linlin;  Chen, Xi;  Liu, Jiazheng;  Yuan, Jingbin;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
Adobe PDF(1914Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：362/55  |  提交时间：2022/01/27
3D reconstruction  ATUM-SEM  deep learning  liver  ER  MCSs  
Robust Global Optimized Affine Registration Method for Microscopic Images of Biological Tissue 会议论文
, Barcelona, Spain, 4-8 May 2020
作者:  Lv YN(吕亚楠);  Chen X(陈曦);  Shu C(舒畅);  Han H(韩华)
Adobe PDF(579Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：270/83  |  提交时间：2021/05/26
Volume reconstruction  registration  affine transformation  
Human attention-inspired volume reconstruction method on serial section electron microscopy images 期刊论文
CYTOMETRY PART A, 2021, 页码: 11
作者:  Zhou, Fangxu;  Shen, Lijun;  Chen, Bohao;  Chen, Xi;  Hua, Han
收藏  |  浏览/下载：269/0  |  提交时间：2021/04/27
3D volume reconstruction  electron microscopy image  image registration  
Sparse self-attention aggregation networks for neural sequence slice interpolation 期刊论文
BioData Mining, 2021, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 19
作者:  Wang, Zejin;  Liu, Jing;  Chen, Xi;  Li, Guoqing;  Han, Hua
Adobe PDF(5022Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：332/48  |  提交时间：2021/02/18
Slice interpolation  Biological tissue recovery  EM images  Sparse self-attention network  Adaptive style-balance loss