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A robust transformer-based pipeline of 3D cell alignment, denoise and instance segmentation on electron microscopy sequence images 期刊论文
Journal of Plant Physiology, 2024, 页码: 154236
作者:  Jiazheng, Liu;  Yafeng, Zheng;  Limei, Lin;  Jingyue, Guo;  Yanan, Lv;  Jingbin, Yuan;  Hao, Zhai;  Xi, Chen;  Lijun, Shen;  LinLin, Li;  Shunong, Bai;  Hua, Han
Adobe PDF(15549Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：25/7  |  提交时间：2024/06/11
Thickness Estimation of Biological Tissue Sections from Structural Deformation 会议论文
, 中国西安, 2023-9-23
作者:  Jia HZ(贾浩泽);  Lv YN(吕亚楠);  Chen HR(陈浩然);  Chen X(陈曦);  Han H(韩华)
Adobe PDF(2427Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：30/11  |  提交时间：2024/05/31
Electron Microscopic Sequential Images Stitching Based on Belief Propagation 会议论文
Eleventh International Conference on Graphics and Image Processing (ICGIP 2019), Hangzhou, China, 12-14 OCTOBER 2019
作者:  Chang, Sheng;  Zhou, Fangxu;  Chen, Xi;  Han, Hua
Adobe PDF(479Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：146/52  |  提交时间：2023/06/28
Electron Microscope Image  Sequential Image  Image Stitching  Belief Propagation  
STDIN: Spatio-temporal distilled interpolation for electron microscope images 期刊论文
NEUROCOMPUTING, 2022, 卷号: 505, 页码: 188-202
作者:  Wang, Zejin;  Sun, Guodong;  Li, Guoqing;  Shen, Lijun;  Zhang, Lina;  Han, Hua
Adobe PDF(6579Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：276/26  |  提交时间：2022/11/14
Spatio-temporal ensemble  Feedback distillation  Electron microscope interpolation  
UTR: UNSUPERVISED LEARNING OF THICKNESS-INSENSITIVE REPRESENTATIONS FOR ELECTRON MICROSCOPE IMAGE 会议论文
, 美国阿拉斯加, 2021-10
作者:  Xin T(辛桐);  Chen BH(陈波昊);  Chen X(陈曦);  Han H(韩华)
Adobe PDF(2365Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：241/46  |  提交时间：2022/06/14
Feature Descriptor  Unsupervised learning  Electron Microscopy  Image registration  FIB-SEM  
Performance Analysis in Serial-section Electron Microscopy Image Registration of Neuronal Tissue 会议论文
, 美国圣地亚哥, 2022-1
作者:  Chen BH(陈波昊);  Xin T(辛桐);  Han H(韩华);  Chen X(陈曦)
Adobe PDF(1634Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：262/65  |  提交时间：2022/06/14
Registration accuracy  Serial section  Neuronal structure  Spherical deformation model  
Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions 期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY, 2021, 卷号: 13, 期号: 9, 页码: 636-645
作者:  Jiang, Yi;  Li, Linlin;  Chen, Xi;  Liu, Jiazheng;  Yuan, Jingbin;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
Adobe PDF(1914Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：341/48  |  提交时间：2022/01/27
3D reconstruction  ATUM-SEM  deep learning  liver  ER  MCSs  
Robust Global Optimized Affine Registration Method for Microscopic Images of Biological Tissue 会议论文
, Barcelona, Spain, 4-8 May 2020
作者:  Lv YN(吕亚楠);  Chen X(陈曦);  Shu C(舒畅);  Han H(韩华)
Adobe PDF(579Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：247/70  |  提交时间：2021/05/26
Volume reconstruction  registration  affine transformation  
Sparse self-attention aggregation networks for neural sequence slice interpolation 期刊论文
BioData Mining, 2021, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 19
作者:  Wang, Zejin;  Liu, Jing;  Chen, Xi;  Li, Guoqing;  Han, Hua
Adobe PDF(5022Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：308/43  |  提交时间：2021/02/18
Slice interpolation  Biological tissue recovery  EM images  Sparse self-attention network  Adaptive style-balance loss  
Brain activity regulates loose coupling between mitochondrial and cytosolic Ca2+ transients 期刊论文
NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 期号: 10, 页码: 13
作者:  Yuan Lin;  Lin-Lin Li;  Wei Nie;  Xiao lei Liu;  Adler, Avital;  Chi Xiao;  Fujian Lu;  Liping Wang;  Hua Han;  Xianhua Wang;  Wen-Biao Gan;  Heping Cheng
Adobe PDF(3557Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：298/111  |  提交时间：2020/10/14
PROTEIN-KINASE-II  ESSENTIAL COMPONENT  DENDRITIC SPINES  MOTOR CORTEX  CALCIUM  DYSFUNCTION  FREQUENCY  DYNAMICS  DISEASE  ER