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A robust transformer-based pipeline of 3D cell alignment, denoise and instance segmentation on electron microscopy sequence images 期刊论文
Journal of Plant Physiology, 2024, 页码: 154236
作者:  Jiazheng, Liu;  Yafeng, Zheng;  Limei, Lin;  Jingyue, Guo;  Yanan, Lv;  Jingbin, Yuan;  Hao, Zhai;  Xi, Chen;  Lijun, Shen;  LinLin, Li;  Shunong, Bai;  Hua, Han
Adobe PDF(15549Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：38/11  |  提交时间：2024/06/11
Joint reconstruction of neuron and ultrastructure via connectivity consensus in electron microscope volumes 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 23
作者:  Hong,Bei;  Liu,Jing;  Zhai,Hao;  Liu,Jiazheng;  Shen,Lijun;  Chen,Xi;  Xie,Qiwei;  Han,Hua
Adobe PDF(3091Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：385/88  |  提交时间：2022/11/14
Connectomics  Reconstruction  Connectivity concept  Joint optimization  Electron microscope volumes  
Sparse self-attention aggregation networks for neural sequence slice interpolation 期刊论文
BioData Mining, 2021, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 19
作者:  Wang, Zejin;  Liu, Jing;  Chen, Xi;  Li, Guoqing;  Han, Hua
Adobe PDF(5022Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：329/47  |  提交时间：2021/02/18
Slice interpolation  Biological tissue recovery  EM images  Sparse self-attention network  Adaptive style-balance loss  
Automatic Reconstruction of Mitochondria and Endoplasmic Reticulum in Electron Microscopy Volumes by Deep Learning 期刊论文
FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, 2020, 期号: 14, 页码: 13
作者:  Liu, Jing;  Li, Linlin;  Yang, Yang;  Hong, Bei;  Chen, Xi;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
浏览  |  Adobe PDF(1944Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：334/77  |  提交时间：2020/09/21
mitochondria  endoplasmic reticulum  electron microscopes  segmentation  3D reconstruction  
Dual Networks for High-Precision and High-Speed Registration of Brain Electron Microscopy Images 期刊论文
Brain Sciences, 2020, 卷号: 10, 期号: 2, 页码: 86
作者:  Shu, Chang;  Xin, Tong;  Zhou, Fangxu;  Chen, Xi;  Han, Hua
浏览  |  Adobe PDF(1388Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：309/73  |  提交时间：2020/04/27
Computer Vision  Image Processing  Deep Learning  Image Registration  Electron Microscopy Image  Dual Network Architecture  Unsupervised Learning  
无权访问的条目 期刊论文
作者:  Sun, Rong;  Chen, Xi;  Yin, Chun-Ying;  Qi, Lei;  Lau, Pak-Ming;  Han, Hua;  Bi, Guo-Qiang
Adobe PDF(4047Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：74/8  |  提交时间：2019/07/12
Automatic Mitochondria Segmentation for EM Data Using a 3D Supervised Convolutional Network 期刊论文
FRONTIERS IN NEUROANATOMY, 2018, 期号: 12, 页码: 92
作者:  Xiao, Chi;  Chen, Xi;  Li, Weifu;  Li, Linlin;  Wang, Lu;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
浏览  |  Adobe PDF(3873Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：480/88  |  提交时间：2019/01/08
electron microscope  deep learning  volumetric mitochondria segmentation  mitochondria morphology  neuroinformatics  
An automated pipeline for bouton, spine, and synapse detection of in vivo two-photon images 期刊论文
BIODATA MINING, 2017, 卷号: 10, 期号: 10, 页码: 40
作者:  Xie, Qiwei;  Chen, Xi;  Deng, Hao;  Liu, Danqian;  Sun, Yingyu;  Zhou, Xiaojuan;  Yang, Yang;  Han, Hua
浏览  |  Adobe PDF(3659Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：579/180  |  提交时间：2018/10/09
In Vivo Two-photon imagIng  Synapse  Bouton  Spine  Image Enhancement