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Joint reconstruction of neuron and ultrastructure via connectivity consensus in electron microscope volumes 期刊论文
BMC Bioinformatics, 2022, 卷号: 23, 期号: 1, 页码: 23
作者:  Hong,Bei;  Liu,Jing;  Zhai,Hao;  Liu,Jiazheng;  Shen,Lijun;  Chen,Xi;  Xie,Qiwei;  Han,Hua
Adobe PDF(3091Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：306/76  |  提交时间：2022/11/14
Connectomics  Reconstruction  Connectivity concept  Joint optimization  Electron microscope volumes  
Performance Analysis in Serial-section Electron Microscopy Image Registration of Neuronal Tissue 会议论文
, 美国圣地亚哥, 2022-1
作者:  Chen BH(陈波昊);  Xin T(辛桐);  Han H(韩华);  Chen X(陈曦)
Adobe PDF(1634Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：228/56  |  提交时间：2022/06/14
Registration accuracy  Serial section  Neuronal structure  Spherical deformation model  
Three-dimensional ATUM-SEM reconstruction and analysis of hepatic endoplasmic reticulum-organelle interactions 期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY, 2021, 卷号: 13, 期号: 9, 页码: 636-645
作者:  Jiang, Yi;  Li, Linlin;  Chen, Xi;  Liu, Jiazheng;  Yuan, Jingbin;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
Adobe PDF(1914Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：303/41  |  提交时间：2022/01/27
3D reconstruction  ATUM-SEM  deep learning  liver  ER  MCSs  
An effective AI integrated system for neuron tracing on anisotropic electron microscopy volume 期刊论文
Biomedical Signal Processing and Control, 2021, 卷号: 69, 期号: 无, 页码: 102829
作者:  Liu, Jing;  Hong, Bei;  Chen, Xi;  Xie, Qiwei;  Tang, Yuanyan;  Han, Hua
Adobe PDF(14559Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：231/33  |  提交时间：2022/01/12
Neuron tracing  Electron microscopy  Deep learning  Convolutional LSTM  
Sparse self-attention aggregation networks for neural sequence slice interpolation 期刊论文
BioData Mining, 2021, 卷号: 14, 期号: 1, 页码: 19
作者:  Wang, Zejin;  Liu, Jing;  Chen, Xi;  Li, Guoqing;  Han, Hua
Adobe PDF(5022Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：271/36  |  提交时间：2021/02/18
Slice interpolation  Biological tissue recovery  EM images  Sparse self-attention network  Adaptive style-balance loss  
Automatic Reconstruction of Mitochondria and Endoplasmic Reticulum in Electron Microscopy Volumes by Deep Learning 期刊论文
FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, 2020, 期号: 14, 页码: 13
作者:  Liu, Jing;  Li, Linlin;  Yang, Yang;  Hong, Bei;  Chen, Xi;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
浏览  |  Adobe PDF(1944Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：277/62  |  提交时间：2020/09/21
mitochondria  endoplasmic reticulum  electron microscopes  segmentation  3D reconstruction  
An Effective Encoder-Decoder Network for Neural Cell Bodies and Cell Nucleus Segmentation of EM Images 会议论文
, 德国柏林, 2019-7
作者:  Jiang Yi;  Xiao Chi;  Li Linlin;  Shen Lijun;  Chen Xi;  Han Hua
Adobe PDF(6217Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：187/49  |  提交时间：2022/06/14
Encoder-Decoder  Electron Microscopy  Neural Cell Bodies  Cell Nucleus  Image Segmentation  
无权访问的条目 会议论文
作者:  Chen, Xi;  Shen, Lijun;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
Adobe PDF(765Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：40/4  |  提交时间：2019/10/08
Automatic Mitochondria Segmentation for EM Data Using a 3D Supervised Convolutional Network 期刊论文
FRONTIERS IN NEUROANATOMY, 2018, 期号: 12, 页码: 92
作者:  Xiao, Chi;  Chen, Xi;  Li, Weifu;  Li, Linlin;  Wang, Lu;  Xie, Qiwei;  Han, Hua
浏览  |  Adobe PDF(3873Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：422/73  |  提交时间：2019/01/08
electron microscope  deep learning  volumetric mitochondria segmentation  mitochondria morphology  neuroinformatics  
An effective fully deep convolutional neural network for mitochondria segmentation based on ATUM-SEM 会议论文
, 美国休斯敦, 2018-2
作者:  Xiao C(肖驰);  Li WF(李伟夫);  Chen X(陈曦);  Han H(韩华);  Xie QW(谢启伟)
浏览  |  Adobe PDF(1314Kb)  |  收藏  |  浏览/下载：293/95  |  提交时间：2019/05/10
Electron Microscope, Deep learning, Mitochondria segmentation